گروه پژوهشی زیست شناسی سامانه‌ها در سال 1393 با ادغام بخش های ژنومیکس (تاسیس 1379) و بیوانفورماتیک (تاسیس 1382) راه‌اندازی شده و در زمینه ارتقاء کمی و کیفی محصولات کشاورزی با به‌کارگیری فناوری‌های امیکس فعالیت می کند. همچنین این بخش با  آنالیز داده‌های High Throughput با استفاده از نرم‌افزارهای اختصاصی تلاش می‌کند تا این داده‌ها در برنامه‌های اصلاح مولکولی به‌کار گرفته شوند. این فناوری‌ها به طور خاص در حل مشکل تنش‌های محیطی زنده (شامل آفات و بیماری‌ها) و غیر زنده (شامل خشکی و شوری) مورد استفاده قرار می‌گیرند.