logo
dividerاعضاء هیئت علمیdividerزهرا سادات شُبَّر
اعضاء هیئت علمی پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران
دانشیار
زهرا سادات شُبَّر
دانشیار
tel 026-32703536
email shobbar@abrii.ac.ir
  • معرفی کلی
  • تحقیقات
  • مقالات علمی
  • دستاوردها

دکتر زهرا سادات شُبَّر مدرک کارشناسی را در رشته زیست شناسی- علوم گیاهی (سال 1376) از دانشکده علوم دانشگاه تهران، کارشناسی ارشد را در رشته زیست شناسی- ژنتیک (سال 1378) از دانشکده علوم دانشگاه تربیت مدرس، و دکتری را در رشته اصلاح نباتات- ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک (سال 1386) از دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس (در هر سه مقطع با رتبه اول) اخذ نمود. وی پایان نامه ارشد خود (برنده جایزه بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس) را در پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و رساله دکتری را در آزمایشگاه زیست شناسی مولکولی گیاهی مؤسسه تحقیقات بین المللی برنج (IRRI) به انجام رسانید و با درجه عالی (نمره 20) از آنها دفاع کرد. از آن پس، ایشان به عنوان عضو هیأت علمی در پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی مشغول به کار است.

تحقیقات وی بر روی کشف ژن ها و سازوکارهای دخیل در تحمل به تنش های غیرزیستی (به ویژه خشکی و شوری) در گیاهان زراعی (به ویژه غلات و حبوبات) متمرکز شده و از ترکیبی از روش ­های آزمایشگاهی و بیوانفورماتیکی برای شناسایی، بررسی بیان و عملکرد ژن ها و خانواده های ژنی مرتبط، بازسازی شبکه های ژنی درگیر، شناسایی ژن های هاب و بررسی مقایسه ای گیاهان زراعی بهره می جوید. همچنین گروه تحقیقاتی ایشان با استفاده از روش ­های علمی به روز و متنوعی از جمله تجزیه تحلیل متا، تلفیق انواع داده ها، روش های مبتنی بر یادگیری ماشین و ... به شناسایی نواحی ژنومی دخیل در تحمل/مقاومت به تنش ها و معرفی نشانگرهای اختصاصی قابل استفاده در برنامه های به نژادی می پردازند. این گروه پژوهشی ضمن همکاری با دانشگاه ها و موسسات ملی و بین المللی، تحقیقات پایه را با پژوهش های کاربردی پیوند زده و تلاش در بهبود وضعیت کشاورزی کشور دارند.

طرح- توسعه لاین های امیدبخش برنج متحمل به شوری با زمینه ارقام ایرانی

پروژه- شناسایی و اعتبار سنجی نشانگرهای مولکولی پیوسته با ژن های تحمل به شوری برنج جهت استفاده در برنامه های اصلاحی برنج

پروژه- تولید لاین نخود مقاوم به بیماری پژمردگی فوزاریوم (Fusarium oxysporum f. sp. ciceris) به روش تلاقی برگشتی مبتنی بر نشانگر (مشترک با موسسه دیم)

پروژه- شناسایی متا QTL ها و ژنهای نامزد دخیل در تحمل به خشکی در ارزن دم روباهی به منظور دستیابی به نشانگرهای اختصاصی قابل استفاده در برنامه های اصلاحی

پروژه- ارزیابی زراعی، بیوشیمیایی و مولکولی ژرم‌پلاسم گلرنگ در شرایط دیم برای گزینش ژنوتیپ‌های بی‌خار با میزان روغن دانه و محتوی اسید اولئیک بالا

پروژه- بررسی عملکردی ژن های نامزد دخیل در تحمل تنش خشکی و تعیین آرایش سیستم ریشه ای با استفاده از آنالیزمتا QTL و بررسی خانواده های ژنی

پروژه- شناسایی و بررسی بیان ژن‌های نامزد دخیل در تحمل به تنش‌ شوری در گندم

پروژه- بررسی ترانسکریپتوم ریشه ژنوتیپ های آستانه ای برنج در پاسخ به تنش خشکی به منظور شناسایی ژن های کلیدی درگیر در آرایش سیستم ریشه ای

پروژه- بررسی تاثیر تنش شوری بر بیان برخی ژن‌های کلیدی دخیل در متابولیسم فروکتان در گندم

پروژه- مطالعه سازوکارهای تحمل به خشکی در ارقام و لاین‌های سورگوم دانه‌ای منتخب از طریق بررسی برخی صفات فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی و مولکولی

طرح- شناسایی، بررسی بیان و عملکرد ژن‌های پاسخ‌دهنده به تنش‌های غیرزیستی در برنج

پروژه- بررسی بیان ژن OsABF1 و OsVP1، دو عامل رونویسی نامزد دخیل در توقف رشد القا شونده با ABA، تحت تنش شوری، خشکی و سرما در ارقام مختلف برنج

پروژه- بررسی بیان ژن OsPP2C5، یک پروتئین فسفاتاز نامزد دخیل در ترارسانی پیام ABA، تحت تنش شوری، اسمزی و سرما در ارقام مختلف برنج

پروژه- بررسی عملکرد دو ژن پاسخ دهنده به خشکی (OsVP1 و OsPP2C5) از طریق مطالعه لاین‌های جهش یافته برنج

پروژه- شناسایی و کلون‌سازی ژن/خانواده ژنی چالکون سنتاز گیاه خار مریم

پروژه- بررسی بیان ژن‌های نامزد دخیل در تجمع کربوهیدرات‌های محلول در ژنوتیپ های جو در شرایط تنش خشکی

طرح- بررسی بیوانفورماتیکی ویژگی‌های ژن‌ها/پروتئین‌های پاسخ دهنده به تنش‌ خشکی در برنج

پروژه- پایه گذاری پایگاه داده‌های ژن‌های پاسخ دهنده به تنش‌خشکی در برنج

پروژه- آنالیز پروموترها، فاکتورهای نسخه برداری، محل های اتصال فاکتورهای نسخه برداری ژن‌های پاسخ دهنده به تنش‌خشکی در برنج

پروژه- بررسی بیوانفورماتیکی توالی پروتئین‌ها، موتیف ها، دومین ها و برهم‌کنش پروتئین - پروتئینی ژن‌های پاسخ دهنده به تنش‌خشکی در برنج

پروژه- بررسی بیوانفورماتیکی ترانسکریپتوم جو در پاسخ به تنش‌ خشکی

پروژه- بررسی بیان ژن‌های رمزده ترانسپورترهای سدیم (SOS1، HKT1 و NHX1) در دو ژنوتیپ‌ گندم ایرانی با درجات مختلف تحمل شوری

پروژه- خانواده ژنی گلوتاتیون S-ترانسفراز (GST) در جو: شناسایی اعضا، بررسی الگوی بیان و فعالیت آنزیمی

مقالات مهم چاپ شده در مجلات معتبر بین المللی  (Selected Papers)​

 

Fatemeh Loni, Ahmad Ismaili, Babak Nakhoda, Hadi Darzi Ramandi, and Zahra-Sadat Shobbar (2023) The genomic regions and candidate genes associated with drought tolerance and yield-related traits in foxtail millet: an integrative meta-analysis approach, Plant Growth Regulation: 1-17 (Q1, Impact Factor= 3.607)

Alireza Akbari, Ahmad Ismaili, Nazanin Amirbakhtiar, Masoumeh Pouresmael, Zahra-Sadat Shobbar (2023) Genome-wide transcriptional profiling provides clues to molecular mechanisms underlying cold tolerance in chickpea. Scientific Repots 13, 6279. https://doi.org/10.1038/s41598-023-33398-3 (Q1, Impact Factor= 5.516)

Razieh Sarabadani Tafresh, Zahra-Sadat Shobbar, Maryam Shahbazi, Mohammadreza Bihamta, Amin Karami, Mohammad Moradi, Hamidreza Nikkhah (2023). Role of barley stem reserves in the maintenance of grain yield under terminal drought. Crop Science, 00, 00– 00. https://doi.org/10.1002/csc2.20919 (Q1, Impact Factor= 2.763)

Raheleh Mirdar Mansuri, Amir-Hossein Azizi, Amir-Hossein Sadri, Zahra-Sadat Shobbar (2022). Long non-coding RNAs as the regulatory hubs in rice response to salt stress. Scientific Repots 12, 21696. https://doi.org/10.1038/s41598-022-26133-x  (Q1, Impact Factor=5.516)

Somayeh Abdirad, Mohammad Reza Ghaffari, Ahmad Majd, Saeed Irian, Armin Soleymaniniya, Parisa Daryani, Parisa Koobaz, Zahra-Sadat Shobbar, Laleh Karimi Farsad, Parisa Yazdanpanah, Amirhossein Sadri, Mehdi Mirzaei, Zahra Ghorbanzadeh, Mehrbano Kazemi, Naghmeh Hadidi, Paul A Haynes, Ghasem Hosseini Salekdeh (2022): Genome-Wide Expression Analysis of Root Tips in Contrasting Rice Genotypes Revealed Novel Candidate Genes for Water Stress Adaptation. Frontiers in plant science 2022 Feb 21;13:792079. doi: 10.3389/fpls.2022.792079. PMID: 35265092; PMCID: PMC8899714. (Q1, Impact Factor= 6.627)

Soorni J, Shobbar Z-S, Kahrizi D, Zanetti F, Sadeghi K, Rostampour S, Kovács PG, Kiss A, Mirmazloum I. )2022( Correlational Analysis of Agronomic and Seed Quality Traits in Camelina sativa Doubled Haploid Lines under Rain-Fed Condition. Agronomy.; 12(2):359. https://doi.org/10.3390/agronomy12020359 (Q1, Impact Factor=2.863)

Parisa Daryani, Hadi Darzi Ramandi, Sara Dezhsetan, Raheleh Mirdar Mansuri, Ghasem Hosseini Salekdeh, Zahra-Sadat Shobbar (2021) Pinpointing genomic regions associated with root system architecture in rice through an integrative meta-analysis approach . Theoretical and Applied Genetics: 1-26. https://doi.org/10.1007/s00122-021-03953-5 (Q1, Impact Factor= 5.699 )

Amirbakhtiar N, Ismaili A, Ghaffari M-R, Mirdar Mansuri R, Sanjari S, Shobbar Z-S (2021) Transcriptome analysis of bread wheat leaves in response to salt stress. PLoS ONE 16(7): e0254189. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0254189 (Q1, 4-year Impact Factor=3.57)  

Sepideh Sanjari, Zahra-Sadat Shobbar, Faezeh Ghanati, Sanaz Afshari-Behbahanizadeh, Mostafa Farajpour, Mojtaba Jowkar, Azim Khazaei, Maryam Shahbazi (2021) Molecular, chemical, and physiological analyses of sorghum leaf wax under post-flowering drought stress, Plant Physiology and Biochemistry, 15: 383-391. DOI: 10.1016/j.plaphy.2021.01.001. (Q1, Impact Factor= 4.27)

Raheleh Mirdar Mansuri, Zahra-Sadat Shobbar, Nadali Babaeian Jelodar, Mohammadreza Ghaffari, Seyed Mahdi Mohammadi, Parisa Daryani (2020) Salt tolerance involved candidate genes in rice: an integrative meta-analysis approach, BMC Plant Biology, 20 (1), 1-14 DOI: 10.1186/s12870-020-02679-8 (Q1, Impact Factor= 4.494)

B. Yazdani, S. Sanjari, R. Asghari-Zakaria, F. Ghanegolmohammadi, E. Pourabed, M. Shahbazi and Z .-S. Shobbar (2020) Revision of the barley WRKY gene family members and phylogeny, plus expression analysis of the candidate genes in response to drought, Biologia plantarum, 64: 9-19  DOI: 10.32615/bp.2019.109 (Q1, Impact Factor=1.384)

Ali Akbar Ghotbi-Ravandi, Mansour Shariati, Zahra-Sadat Shobbar, Maryam Shahbazi (2019) Expression pattern and physiological roles of Plastid Terminal Oxidase (PTOX) in wild and cultivated barley genotypes under drought stress, Environmental and Experimental Botany DOI: 10.1016/j.envexpbot.2019.03.007 (Q1, Impact Factor=3.666)

Nazanin Amirbakhtiar, Ahmad Ismaili, Mohammad Reza Ghaffari, Farhad Nazarian Firouzabadi, Zahra-Sadat Shobbar (2019) Transcriptome response of roots to salt stress in a salinity-tolerant bread wheat cultivar, PLOS ONE DOI: 10.1371/journal.pone.0213305 (Q1, 4-year Impact Factor=3.344)

Raheleh Mirdar Mansuri, Zahra-Sadat Shobbar, Nadali Babaeian Jelodar, Mohammad-Reza Ghaffari, Ghorban-Ali Nematzadeh, Saeedeh Asari (2019) Dissecting Molecular Mechanisms Underlying Salt Tolerance in Rice: A Comparative Transcriptional Profiling of the Contrasting Genotypes, Rice 12 (1), 13 DOI : 10.1186/s12284-019-0273-2 (Q1, 5-year Impact Factor=4.45)

Sepideh Sanjari, Reza Shirzadian-Khoramabad, Zahra-Sadat Shobbar*, Maryam Shahbazi (2019) Systematic analysis of NAC transcription factors’ gene family and identification of post-flowering drought stress responsive members in sorghum. Plant Cell Reports, DOI: 10.1007/s00299-019-02371-8 (Q1, 4-year Impact Factor=3.334)

Raha Abedini, Farzan GhaneGolmohammadi, Reihaneh PishkamRad, Ehsan Pourabed, Ahad Jafarnezhad, Zahra-Sadat Shobbar, Maryam Shahbazi (2017) Plant dehydrins: shedding light on structure and expression patterns of dehydrin gene family in barley. Journal of plant research. 130:747–763. (Q1, Impact Factor=1.684)

Mahrokh Sharbatkhari, Zahra-Sadat Shobbar *, Serrollah Galeshi, Babak Nakhoda (2016)Wheat stem reserves and salinity tolerance: molecular dissection of fructan biosynthesis and remobilization. Planta. 244(1): 191-202. (Q1, Impact Factor=3.239)

Zahra Gerivani, Hamid Reza Sadeghipour, Mahnaz Aghdasi, Zahra-Sadat Shobbar, Majid Azimmohseni (2016) Short versus long term effects of cyanide on sugar metabolism and transport in dormant walnut kernels. Plant Science. 252: 193–204. (Q1, Impact Factor=3.982)

Ehsan Pourabed, Farzan Ghane Golmohamadi, Peyman Soleymani Monfared, Seyed Morteza Razavi, Zahra-Sadat Shobbar (2015) Basic Leucine Zipper Family in Barley: Genome-Wide Characterization of Members and Expression Analysis. Molecular Biotechnology. 57:12-26.

Mohammad Kazem Rezaei, Zahra-Sadat Shobbar*, Maryam Shahbazi, Raha Abedini, Sajjad Zare (2013) Glutathione S-transferase (GST) family in barley: Identification of members, enzyme activity, and gene expression pattern. Journal of Plant Physiology, 170 (14): 1277-1284. (Q1, Impact Factor=3.241)

Amin Karami, Maryam Shahbazi*, Vahid Niknam, Zahra Sadat Shobbar, Razieh Sarabadani Tafreshi, Raha Abedini, Hasan Ebrahimzadeh Mabood (2013) Expression analysis of dehydrin multigene family across tolerant and susceptible barley (Hordeum vulgare L.) genotypes in response to terminal drought stress. Acta Physiologiae Plantarum, 35 (7): 2289-2297. (Q2, Impact Factor= 1.59)

Maryam-Sadat Shobbar, Omid Azhari, Zahra-Sadat Shobbar*, Vahid Niknam, Hossein Askari, Mohammad Pessarakli, and Hasan Ebrahimzadeh (2012) Comparative analysis of some physiological responses of rice seedlings to cold, salt and drought stresses. Journal of Plant Nutrition. 35:1037-1052. (Q2, Impact Factor=1.001)

Muthurajan R, Shobbar ZS, Jagadish SV, Bruskiewich R, Ismail A, Leung H, Bennett J. (2011) Physiological and proteomic responses of rice peduncles to drought stress. Molecular Biotechnology. 48:173–182.

Zahra-Sadat Shobbar, Rowena Oane, Rico Gamuyao, Justina de Palma, Mohammad Ali Malboobi, Ghasem Karimzadeh, Mokhtar Jalali Javaran, John Bennett* (2008) Abscisic acid regulates gene expression in cortical fiber cells and silica cells of rice shoots. New phytologist 178 (1): 68-79. (Q1, Impact Factor= 7.07)

 

 

"نظر به اهمیت غلات و حبوبات در امنیت غذایی مردم ایران و تاثیر منفی تنش های زیستی و غیر زیستی بر عملکرد این گیاهان زراعی، عمده فعالیت تحقیقاتی ایشان در ده سال اخیر به طور منسجم و هدفمند بر شناسایی، بررسی بیان و عملکرد ژن‌ ها/ خانواده¬ های ژنی/شبکه ¬های ژنی دخیل در تحمل به تنش‌ های غیرزیستی (به ویژه خشکی و شوری) و زیستی و شناسایی نواحی ژنومی دخیل در تحمل/مقاومت به تنش ها و معرفی نشانگرهای اختصاصی قابل استفاده در برنامه های به نژادی در غلات و حبوبات متمرکز بوده است. بخشی از نتایج حاصل در بیش از 80 مقاله علمی پژوهشی در مجلات معتبر بین¬المللی (بیش از 20 مقاله Q1) و داخلی منتشر شده است و بیش از 800 بار ارجاع خورده است. همچنین ثبت چندین ژن در بانک ژن بین المللی و کلان داده مرتبط در پایگاه NCBI داشته است.

با مشارکت فعال در طرح ها و پروژه های مشترک با موسسات تحقیقاتی کشور (از جمله موسسه تحقیقات برنج کشور، موسسه تحقیقات دیم کشور، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه بذر و نهال و قطب علمی تنش های محیطی در غلات) تلاش شده است تا از نتایج حاصل از پژوهش های انجام شده، در راستای اصلاح مولکولی گیاهان زراعی و افزایش عملکرد در شرایط موجود کشور (مواجه با تنش های زیستی و غیر زیستی) استفاده شود. تا کنون در معرفی یک رقم زودرس و متحمل به خشکی سورگوم دانه ای، به نام فومن، مناسب برای کشت در مناطق مختلف کشور و یک پروژه تحقیقاتی مربوط به تولید یک لاین نخود مقاوم به بیماری پژمردگی فوزاریوم به روش تلاقی برگشتی مبتنی بر نشانگر (مشترک با موسسه دیم) که از سال جاری مراحل سازگاری و پایداری عملکرد آن به منظور معرفی رقم آغاز می شود، و طرح توسعه لاین¬های امیدبخش برنج متحمل به شوری با زمینه ارقام ایرانی مشارکت داشته است."

 

 

 

© تمامی حقوق برای پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی محفوظ است.طراحی شده توسط طراحی سایت داتک